Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrdQ8K2M3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms