Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms