Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Mtmr3Q8K296 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Mtmr3Q8K296 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Mtmr3Q8K296 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Mtmr3Q8K296 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Mtmr3Q8K296 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Mtmr3Q8K296 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Mtmr3Q8K296 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Mtmr3Q8K296 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Mtmr3Q8K296 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Mtmr3Q8K296 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Mtmr3Q8K296 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr3Q8K296 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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