Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c1Q8K284 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms