Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms