Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms