Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkn3Q8K045 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms