Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Card11Q8CIS0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms