Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mterf1aQ8CHZ9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms