Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms