Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Csnka2ipQ8CH19 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Csnka2ipQ8CH19 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Csnka2ipQ8CH19 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Csnka2ipQ8CH19 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Csnka2ipQ8CH19 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Csnka2ipQ8CH19 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Csnka2ipQ8CH19 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Csnka2ipQ8CH19 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Csnka2ipQ8CH19 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnka2ipQ8CH19 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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