Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms