Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cc2d2aQ8CFW7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cc2d2aQ8CFW7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms