Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hpf1Q8CFE2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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