Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef8Q8CE24 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms