Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8CDS7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8CDS7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8CDS7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8CDS7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8CDS7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8CDS7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms