Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc9Q8CDN9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc9Q8CDN9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms