Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms