Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nhlrc3Q8CCH2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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