Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd4aQ8CBY1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms