Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Lrrn3Q8CBC6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Lrrn3Q8CBC6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Lrrn3Q8CBC6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms