Protein–RNA interactions for Protein: Q8C966

Phf21b, PHD finger protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21bQ8C966 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf21bQ8C966 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms