Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dclre1bQ8C7W7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dclre1bQ8C7W7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dclre1bQ8C7W7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dclre1bQ8C7W7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dclre1bQ8C7W7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dclre1bQ8C7W7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms