Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms