Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms