Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Amigo3Q8C2S7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Amigo3Q8C2S7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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