Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh12Q8BYK4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh12Q8BYK4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms