Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

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Length 3,748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vps13cQ8BX70 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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