Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms