Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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