Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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