Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pdcl3Q8BVF2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdcl3Q8BVF2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms