Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms