Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nup54Q8BTS4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms