Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gga3Q8BMI3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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