Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hirip3Q8BLH7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hirip3Q8BLH7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms