Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms