Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf4Q8BH24 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms