Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms