Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Htatsf1Q8BGC0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms