Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms