Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc172Q810N9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms