Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Liat1Q810M6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms