Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8Q80YR6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms