Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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Npm2Q80W85 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Npm2Q80W85 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms