Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpp38Q80UU2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpp38Q80UU2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpp38Q80UU2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpp38Q80UU2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpp38Q80UU2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpp38Q80UU2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpp38Q80UU2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpp38Q80UU2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpp38Q80UU2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpp38Q80UU2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpp38Q80UU2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpp38Q80UU2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpp38Q80UU2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms