Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms