Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170bQ80U49 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep170bQ80U49 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms