Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo2Q7TSY8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms