Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Clec18aQ7TSQ1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Clec18aQ7TSQ1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Clec18aQ7TSQ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Clec18aQ7TSQ1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Clec18aQ7TSQ1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec18aQ7TSQ1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms